La red troncal se extiende desde Arica hasta Osorno, encontrándose en su cuarta versión. A comienzos de los 90´s, partió como una red de tres nodos con capacidad de Kbps. Hacia fines de esa década pasó a ser una red de 8 nodos con tecnología ATM y capacidad de 155Mbps. Luego, entre el 2005 y 2006, se amplió a 10 nodos y cimentó el camino (con el recambio completo de equipamiento) hacia una red de capacidades de Gbps (ver diagrama).

La cuarta versión de la troncal de la red cuenta con capacidades que van desde 2,5Gbps a 0,5Gbps, lo que considera la infraestructura de alta capacidad existente entre Antofagasta y Santiago, construida en el marco del proyecto EVALSO; la ampliación de 1Gbps desde Valparaíso a Osorno y la construcción de una red fotónica en la Región Metropolitana, como parte del proyecto NLHPC. En materia de servicios sobre la red troncal operan servicios como transporte de capa 2 (VLAN), QoS (Calidad de Servicio), Multicast e IPv6, entre otros.
Cambios recientes Tanto en materia de crecimiento en la troncal como para potenciar los Nodos Regionales, se ha identificado la tecnología DWDM como la solución para implementar una red de transporte que permita entregar no sólo capacidades sino tipos de servicios acordes a lo que requieren las instituciones miembros de REUNA. De este modo, en el tramo Antofagasta, Copiapó, La Serena y Santiago, REUNA opera una red basada en una longitud mediante equipamiento DWDM propio, sobre este lambda se transporta un canal de 2,5Gbps destinado a la red académica específicamente. Por otra parte, en el nodo de Santiago, REUNA gestiona la primera red fotónica académica a nivel nacional, compuesta por 10 sitios con tecnología DWDM, entre los que se pueden intercambiar longitudes de onda OTU-2 (10Gbps) y OTU-1(2,5Gbps) para establecer diferentes canales de comunicación o servicio entre los sitios (ver diagrama).
A futuroSe proyecta seguir creciendo en el despliegue de la red fotónica, no sólo buscando satisfacer los requerimientos de los grupos científicos/académicos del área de Santiago, sino que en otros nodos regionales a lo largo del país, a medida que se vayan generando las oportunidades.
Otro desafío es implementar un anillo en el nodo de Santiago, en lugar de sólo realizar conexiones en estrella, a fin de contar con redundancia en algunos enlaces.
También se ha asumido la tarea de explorar tendencias tecnológicas que puedan presentar un beneficio para las comunidades de REUNA. Una de estas líneas de exploración se relaciona con el concepto de redes gestionadas por software (ver
Proyecto Redes Virtuales).