La Corporación es dirigida y administrada por un Directorio compuesto por seis miembros que son elegidos por la Asamblea General Ordinaria. La tarea de este cuerpo es velar por el respeto al principio de representación de las instituciones miembros de REUNA.
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Presidente: José Palacios Representante de la Universidad de Atacama.
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Primer Vicepresidente: César González Representante Institucional de la Universidad de Concepción.
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Segundo Vicepresidente: Milton Ramírez Representante Institucional de la Universidad del Bío-Bío.
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Secretario: René Viancos Representante Institucional de la Universidad de La Serena.
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Tesorero: Alberto Martínez Representante Institucional de la Universidad Arturo Prat.
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Director: Juan Pablo Rozas Representante Institucional de la Universidad de Chile.
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